故事讲述了过着平凡生活的男主樱羽一时，在某一天突然知道了自己是伊贺忍者第19代正当继承人后，而青梅竹马居然是超强实力派的女忍者，随着忍者身份被发现被迫卷入忍者的世界纷争。